Résultat de recherche

Résultats de recherche par année 2010 2010 2011 2012 2014 2015 2017 2020

• 12 Article
• 3 Comment/debate
• 1 Chapter

Résultats de recherche par année

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• 2020

  Comparative Plastid Genomics of Cryptomonas Species Reveals Fine-Scale Genomic Responses to Loss of Photosynthesis

  Tanifuji, G., Kamikawa, R., Moore, C. E., Mills, T., Onodera, N. T., Kashiyama, Y., Archibald, J. M., Inagaki, Y. & Hashimoto, T., févr. 8 2020, Dans: Genome Biology and Evolution. 12, 2, p. 3926-3937 12 p.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  Accès libre

  • Cryptophyta 100%
  • Plastids 74%
  • Cryptomonas 73%
  • Plastid Genomes 72%
  • Photosynthesis 72%
  18 Citations (Scopus)
• 2017

  Aseptic rearing procedure for the stinkbug Plautia stali (Hemiptera: Pentatomidae) by sterilizing food-derived bacterial contaminants

  Nishide, Y., Onodera, N. T., Tanahashi, M., Moriyama, M., Fukatsu, T. & Koga, R., août 1 2017, Dans: Applied Entomology and Zoology. 52, 3, p. 407-415 9 p.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  • Plautia stali 100%
  • bacterial contamination 69%
  • sterilizing 69%
  • Pentatomidae 69%
  • Hemiptera 50%
  18 Citations (Scopus)

• Cryptomonads: A Model Organism Sheds Light on the Evolutionary History of Genome Reorganization in Secondary Endosymbioses

  Tanifuji, G. & Onodera, N. T., 2017, Advances in Botanical Research. Academic Press Inc., p. 263-320 58 p. (Advances in Botanical Research; vol. 84).

  Medicine

  Résultat de recherche: Chapter

  • Cryptophyceae 100%
  • symbiosis 64%
  • history 51%
  • organisms 38%
  • genome 37%
  13 Citations (Scopus)

• Genome sequencing reveals metabolic and cellular interdependence in an amoeba-kinetoplastid symbiosis

  Tanifuji, G., Cenci, U., Moog, D., Dean, S., Nakayama, T., David, V., Fiala, I., Curtis, B. A., Sibbald, S. J., Onodera, N. T., Colp, M., Flegontov, P., Johnson-Mackinnon, J., McPhee, M., Inagaki, Y., Hashimoto, T., Kelly, S., Gull, K., Lukeš, J. & Archibald, J. M., déc. 1 2017, Dans: Scientific Reports. 7, 1, 11688.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  Accès libre

  • Symbiosis 100%
  • Amoeba 95%
  • Eukaryota 75%
  • Genome 49%
  • Microbodies 30%
  49 Citations (Scopus)
• 2016

  Erratum: Proposal of a twin aarginine translocator system-mediated constraint against loss of atp synthase genes from nonphotosynthetic plastid genomes (Molecular Biology and Evolution 32(10): 2015 (2598-2604)) doi:10.1093/molbev/msv134

  Kamikawa, R., Tanifuji, G., Ishikawa, S. A., Ishii, K. I., Matsuno, Y., Onodera, N. T., Ishida, K. I., Hashimoto, T., Miyashita, H., Mayama, S. & Inagaki, Y., janv. 1 2016, Dans: Molecular Biology and Evolution. 33, 1, p. 303 1 p.

  Medicine

  Résultat de recherche: Comment/debate › examen par les pairs

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• 2015

  Gene loss and error-prone RNA editing in the mitochondrion of perkinsela, an endosymbiotic kinetoplastid

  David, V., Flegontov, P., Gerasimov, E., Tanifuji, G., Hashimi, H., Logacheva, M. D., Maruyama, S., Onodera, N. T., Gray, M. W., Archibald, J. M. & Lukeš, J., déc. 1 2015, Dans: mBio. 6, 6, e01498-15.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

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  • RNA Editing 100%
  • Mitochondria 59%
  • RNA-Seq 42%
  • Amoebozoa 35%
  • High-Throughput Nucleotide Sequencing 34%
  30 Citations (Scopus)

• Proposal of a twin aarginine translocator system-mediated constraint against loss of ATP synthase genes from nonphotosynthetic plastid genomes

  Kamikawa, R., Tanifuji, G., Ishikawa, S. A., Ishii, K. I., Matsuno, Y., Onodera, N. T., Ishida, K. I., Hashimoto, T., Miyashita, H., Mayama, S. & Inagaki, Y., oct. 2015, Dans: Molecular Biology and Evolution. 32, 10, p. 2598-2604 7 p.

  Medicine

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  Accès libre

  • Plastid Genomes 100%
  • plastid 73%
  • plastid genome 67%
  • H-transporting ATP synthase 55%
  • genome 50%
  38 Citations (Scopus)
• 2014

  Nucleomorph and plastid genome sequences of the chlorarachniophyte Lotharella oceanica: Convergent reductive evolution and frequent recombination in nucleomorph-bearing algae

  Tanifuji, G., Onodera, N. T., Brown, M. W., Curtis, B. A., Roger, A. J., Ka-Shu Wong, G., Melkonian, M. & Archibald, J. M., mai 15 2014, Dans: BMC Genomics. 15, 1, 374.

  Medicine

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

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  • Plastid Genomes 100%
  • Genetic Recombination 51%
  • Genome 36%
  • Synteny 17%
  • Genome Size 16%
  31 Citations (Scopus)

• Reduced nuclear genomes maintain high gene transcription levels

  Tanifuji, G., Onodera, N. T., Moore, C. E. & Archibald, J. M., mars 2014, Dans: Molecular Biology and Evolution. 31, 3, p. 625-635 11 p.

  Medicine

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  • nuclear genome 100%
  • genome 96%
  • gene 78%
  • transcription (genetics) 76%
  • Genome 69%
  18 Citations (Scopus)
• 2013

  Paratrypanosoma is a novel early-branching trypanosomatid

  Flegontov, P., Votýpka, J., Skalický, T., Logacheva, M. D., Penin, A. A., Tanifuji, G., Onodera, N. T., Kondrashov, A. S., Volf, P., Archibald, J. M. & Lukeš, J., sept. 23 2013, Dans: Current Biology. 23, 18, p. 1787-1793 7 p.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

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  • Trypanosomatidae 100%
  • branching 73%
  • Parasitic 64%
  • Naegleria 44%
  • Trypanosomatina 44%
  92 Citations (Scopus)
• 2012

  Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and the fate of nucleomorphs

  Curtis, B. A., Tanifuji, G., Maruyama, S., Gile, G. H., Hopkins, J. F., Eveleigh, R. J. M., Nakayama, T., Malik, S. B., Onodera, N. T., Slamovits, C. H., Spencer, D. F., Lane, C. E., Gray, M. W., Archibald, J. M., Burki, F., Hirakawa, Y., Reyes-Prieto, A., Keeling, P. J., Fast, N. M., Green, B. R., & 51 autresGrisdale, C. J., Gruber, A., Kroth, P. G., Irimia, M., Arias, M. C., Ball, S. G., Kuo, A., Schmutz, J., Grimwood, J., Lindquist, E., Lucas, S., Salamov, A., Grigoriev, I. V., Rensing, S. A., Symeonidi, A., Elias, M., Herman, E. K., Klute, M. J., Dacks, J. B., Oborník, M., Kořený, L., Durnford, D. G., Neilson, J. A. D., Armbrust, E. V., Rocap, G., Aves, S. J., Liu, Y., Beiko, R. G., Coutinho, P., Henrissat, B., Hempel, F., Maier, U. G., Zauner, S., Häppner, M. P., Ishida, K. I., Shirato, S., Suzuki, S., Kim, E., Richards, T. A., Mc Rose, D., Worden, A. Z., Mock, T., Poole, A. M., Pritham, E. J., Roy, S. W., Schaack, S., Bell, C., Bharti, A. K., Crow, J. A., Kramer, R. & Mc Fadden, G. I., déc. 6 2012, Dans: Nature. 492, 7427, p. 59-65 7 p.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  Accès libre

  • Plastids 100%
  • Mosaicism 79%
  • Genome 43%
  • Cytosol 41%
  • Mitochondria 35%
  321 Citations (Scopus)

• Genome sequence of shigella flexneri serotype 5a strain M90T Sm

  Onodera, N. T., Ryu, J., Durbic, T., Nislow, C., Archibald, J. M. & Rohde, J. R., juin 2012, Dans: Journal of Bacteriology. 194, 11, p. 3022 1 p.

  Medicine

  Résultat de recherche: Comment/debate › examen par les pairs

  • Shigella flexneri 100%
  • Serogroup 65%
  • Genome 48%
  • Shigella 45%
  • Cause of Death 28%
  35 Citations (Scopus)
• 2011

  Complete nucleomorph genome sequence of the nonphotosynthetic alga Cryptomonas paramecium reveals a core nucleomorph gene set

  Tanifuji, G., Onodera, N. T., Wheeler, T. J., Dlutek, M., Donaher, N. & Archibald, J. M., 2011, Dans: Genome Biology and Evolution. 3, 1, p. 44-54 11 p.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  Accès libre

  • Cryptophyta 100%
  • Paramecium 75%
  • Cryptomonas 73%
  • Cryptophyceae 55%
  • genome 45%
  60 Citations (Scopus)

• Genomic characterization of neoparamoeba pemaquidensis (Amoebozoa) and its kinetoplastid endosymbiont

  Tanifuji, G., Kim, E., Onodera, N. T., Gibeault, R., Dlutek, M., Cawthorn, R. J., Fiala, I., Lukeš, J., Greenwood, S. J. & Archibald, J. M., août 2011, Dans: Eukaryotic Cell. 10, 8, p. 1143-1146 4 p.

  Résultat de recherche: Comment/debate › examen par les pairs

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  21 Citations (Scopus)
• 2010

  Complex array of endobionts in Petalomonas sphagnophila, a large heterotrophic euglenid protist from Sphagnum-dominated peatlands

  Kim, E., Park, J. S., Simpson, A. G. B., Matsunaga, S., Watanabe, M., Murakami, A., Sommerfeld, K., Onodera, N. T. & Archibald, J. M., sept. 2010, Dans: ISME Journal. 4, 9, p. 1108-1120 13 p.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  Accès libre

  • Sphagnopsida 100%
  • Petalomonas 96%
  • peatlands 64%
  • protist 63%
  • Sphagnum 61%
  26 Citations (Scopus)

• Nucleomorph genome diversity and its phylogenetic implications in cryptomonad algae

  Tanifuji, G., Onodera, N. T. & Hara, Y., juill. 2010, Dans: Phycological Research. 58, 3, p. 230-237 8 p.

  Résultat de recherche: Article › examen par les pairs

  • Cryptophyta 100%
  • Cryptophyceae 71%
  • Genome Size 68%
  • genome 45%
  • alga 40%
  15 Citations (Scopus)